Ссылки на инструкции:
В этой задаче будут исследоваться различные химические и биологические процессы, а одним из основных физических методов исследования будет спектроскопия.
Спектроскопия может быть разная по технике исполнения, а её возможности простираются от определения структуры веществ до движения галактик. Как правило, под спектром имеется в виду зависимость какой-то физической величины (энергии; интенсивности излучения; поглощения и т.д.) от длины волны света.
Реальный луч света всегда является составными объектом. Он состоит из нескольких элементарных лучей разного цвета – волн с разной длиной волны. Разделить реальный луч по элементарным лучам можно с помощью призмы или дифракционной решетки.
Например, из света Солнца с помощью призмы мы получаем радугу. Если датчиком измерить интенсивность в различных цветах в радуге, и построить график этой интенсивности от длины волны, то получится что-то похожее на Рис. 1(а).
Полученный график называют спектром излучения Солнца в видимом диапазоне.
В качестве источника излучения можно взять лампу накаливания, флюоресцентную лампу и светодиоды, с помощью призмы или дифракционной решетки можно получить похожие на радугу изображения и в них измерить интенсивность для различных цветов (см. остальные графики на Рис. 1). Графики показывают с какой интенсивностью источник света излучает в таком-то диапазоне длин волн.
Свет взаимодействует с окружающими нас объектами, и от характера этого взаимодействия зависит видимый цвет объекта. В этой задаче мы будем изучать поглощение света различными растворами. Например, раствор малахитового зеленого, поглощает синий свет (длина волны 450 нм) и красный свет (длина волны 600 нм), но не поглощает зеленый свет (длина 500 нм). Поэтому белый свет проходя через раствор становится зеленым (Рис. 2).
Теперь представим, что мы светим лучом фиксированного цвета (лазером) в раствор малахитового зеленого. Зеленый лазер будет проходить через раствор практически без поглощения ($I_\mathrm{gr} \approx I_{0,\mathrm{gr}}$), а синий сильно поглотится ($I_\mathrm{bl} \ll I_{0,\mathrm{bl}}$).
Поэтому для описания процесса поглощения нужно указать длину волны $\lambda$, с которой мы работаем:
\[A(\lambda) = \log_{10} \frac{I_0(\lambda)}{I(\lambda)}.\]Зависимость $A(\lambda)$ называют спектром поглощения. На рис. 2 построен спектр поглощения малахитового зеленого.
Спектр поглощения $A(\lambda)$ описывается законом Бугера-Ламберта-Бера и зависит от вещества, из которого состоит объект, концентрации этого вещества $n$ и толщины образца $b$:
\[A(\lambda) = n b \cdot \varepsilon(\lambda),\]где $\varepsilon(\lambda)$ — некий коэффициент уникальный для каждого вещества.
Если образец состоит из веществ $A$ и $B$, то их поглощения складываются:
\[A(\lambda) = b\left(n_A\,\varepsilon_A + n_B\,\varepsilon_B\right). \]Если в раствор малахитового зеленого добавить любое вещество, которое поглощает зеленый свет, то раствор станет очень темным, так как будет поглощать почти весь видимый свет проходящий через него.
Для анализа происходящих химических процессов в этой задаче вам нужно будет измерять спектры поглощения растворов медного купороса и ${\rm pH}$-индикаторов в растворах различной кислотности. Также вы получите спектры поглощения фотосинтезирующих пигментов из двух водорослей и с помощью них попробуете объяснить эффективность фотосинтеза при освещении микроорганизмов разными цветами.
В этой части задачи вам предстоит провести электролиз водного раствора $\rm{CuSO}_4$ и различными способами вычислить заряд, протекший через раствор в процессе электролиза.
В процессе электролиза вы сможете наблюдать:
Анализируя результаты этих наблюдений вы рассчитаете заряд, который пришелся на тот или иной эффект, и сравните его с полным зарядом, который протёк через раствор, измеренным прямым методом $Q = I\cdot t$, где $I$ — это ток, текущий через раствор, а $t$ — время электролиза.
\[ \mathrm{H_2O} - e^- \to \mathrm{H^+ + O_2} \uparrow \]
и катоде:
\[ \mathrm{Cu^{2+}} + e^- \to \mathrm{Cu^0}.\]
Считайте, что других реакций на аноде и катоде не происходит.
Запишите и сбалансируйте суммарное уравнение электролиза водного раствора $\rm{CuSO4}$.
\[ \rm Cu SO_4 + H_2O \to\]
Получившийся раствор будем называть “раствор А2”. Отлейте 5 мл раствора A2 в Answer tube A2.
Cнимите зависимость объема выделившегося кислорода $V_{\rm O_2}$ от времени $t$. Выполните не менее 10 измерений. Постройте график получившейся зависимости, проведите аппроксимирующую кривую.
Отфильтрованный раствор будем называть “раствор А4”. Отлейте 5 мл раствора A4 в Answer tube A4.
В этой части вам нужно определить концентрацию ионов меди в растворе A4 исходя из того, как он поглощает свет. Голубой цвет исследуемых растворов полностью определяется концентрацией ионов $\rm Cu^{2+}$.
В оптических кюветах приготовьте пять растворов $\rm CuSO_4$, каждый объемом $4$ мл.
Номер кюветы Молярная концентрация $[\rm Cu^{2+}], ~M$ $V_\textbf{A2},$ мл $V_{\rm H_2O},$ мл 1 0.0400 2 0.0350 3 0.0300 4 0.0250 5 0.0200
Обратите внимание, что поглощение исходного раствора A2 очень сильное, поэтому в этом пункте вы рассчитываете его разбавление в 10 раз и более.
Сохраните измеренные спектры в папку на рабочем столе “Results/B2” под именами “B2.{номер кюветы}.txt” (например, “B2.3.txt”).
В оптической кювете приготовьте 4 мл разбавленного в 10 раз раствора A4.
Сохраните измеренный спектр в папку на рабочем столе “Results/B4” под именем “B4.txt”.
В этой части задачи нужно определить ${\rm pH}$ в растворах A2 и A4 с помощью индикаторов, которые меняют свой цвет в зависимости от $\rm pH$ раствора.
Вам хорошо знакомы, и вы знаете как работать с цветными ${\rm pH}$-индикаторами, такими как метиловый оранжевый или бромтимоловый синий. Эти индикаторы меняют цвет при переходе и кислотной формы в основную. И, как правило, именно по изменению цвета определяется, что ${\rm pH}$ раствора изменился в нужной степени. Однако, используя спектрометр можно определить pH количественно (это возможно вблизи точки перехода).
Рассмотрим, как можно определить ${\rm pH}$, на примере индикатора крезолового красного. Было подготовлено несколько кювет с различными ${\rm pH}$ (от 0.5 до 1.3). В каждую кювету капнули одинаковое количество индикатора. В результате наблюдается переход цвета от красного к оранжевому/желтому (Рис. 4).
Затем были измерены спектры поглощения для каждой из этих кювет и построены совместно на одном графике (Рис. 5).
Какие особенности можно наблюдать на графике:
По поглощению в изобестической точке, таким образом, можно рассчитать концентрацию индикатора, т.к. поглощение в ней не зависит от ${\rm pH}$. Ясно, что если концентрацию индикатора увеличить, например, вдвое, то все значения поглощений тоже увеличатся вдвое, но отношение $A_{peak}/A_{iso}$ останется постоянным и будет соответствовать некоторому ${\rm pH}$.
Получившийся график — универсальный и может быть использован в качестве калибровочного, поскольку отложенные по осям величины не зависят от начальной концентрации индикатора. И с его помощью можно определить ${\rm pH}$ раствора A4.
В двух 2 мл пробирках подготовьте по 500 мкл неразбавленного раствора A4. В одну из них добавьте 25 мкл раствора крезолового красного. Хорошо перемешайте раствор с красителем.
В предыдущем пункте вы определили финальный pH, т.е. концентрацию ионов водорода, в растворе после электролиза. Далее необходимо определить начальный pH раствора до электролиза. pH раствора A2 находится в диапазоне от 3.00 до 5.00. В этом диапазоне хорошо изменяет цвет индикатор бромфеноловый синий. Вашей задачей будет получить для него такое же семейство спектров, как было сделано авторами для крезолового красного (рис. 5).
Можно было бы подготовить растворы разных pH, добавить одинаковое количество индикатора и измерять их спектры. Однако добавлять одинаковое количество индикатора сложно, возникнут большие погрешности в спектрах. Поэтому можно выбрать такой путь:
Суммарный объем прилитой кислоты будет небольшим, поэтому изменением концентрации индикатора можно будет пренебречь.
Для построения графика, аналогичного рис. 5 и в пункте С1, не хватает значений ${\rm pH}$ раствора после каждого добавления концентрированной кислоты. В таблице ниже указана начальная концентрация ${\rm HCl}$, добавляемый на каждом шаге объем $\Delta V$ концентрированной кислоты и концентрация $C_{\rm HCl}$ используемой кислоты. Ваша задача рассчитать значения концентраций раствора $C_{\rm sol}$ и ${\rm pH}$ (до сотых), которые будет иметь раствор на каждом шаге добавления кислоты.
Номер шага $V_0,$ мл $C_{\rm HCl},~{\rm mM}$ $\Delta V,$ мкл $C_{\rm sol},~{\rm mM}$ ${\rm pH}$ 0 4.0 - - 0.010 5.00 1 4.0 10 + 4.0 2 4.0 10 + 8.0 3 4.0 10 + 16.0 4 4.0 10 + 30.0 5 4.0 100 + 6.0 6 4.0 100 + 12.0 7 4.0 100 + 25.0
Далее нужно сделать то же самое, что и в пунктах С2 и С3, но с другим индикатором. В двух 2 мл пробирках подготовьте по 500 мкл неразбавленного раствора A2. В одну из них добавьте 20 мкл раствора бромфенолового синего. Хорошо перемешайте раствор с индикатором.
№ Утверждение Верно Неверно 1 Часть образующегося кислорода утекает через поверхность всего раствора 2 В ходе электролиза молекулярный кислород может образовываться на катоде 3 Образующийся на аноде кислород реагирует с графитовым электродом 4 В ходе эксперимента на электродах кроме кислорода могут образовываться и другие газы 5 Существенная часть медного купороса не диссоциирует в растворе 6 Замена графитового катода на медный не позволит корректно определять заряд по изменению $\operatorname{pH}$ раствора 7 Замена графитового анода на медный приведет к невозможности корректного определения заряда по концентрации ионов меди
$Q_{\mathrm{O}_2}$ $Q_{\mathrm{Cu}}$ $Q_{\operatorname{pH}}$
Фотосинтез — ключевой процесс, происходящий в биосфере нашей планеты, позволяющий организмам использовать энергию солнечного света для обеспечения жизнедеятельности. Благодаря фотосинтезу происходит образование более 99% органических веществ, которые используются для питания организмов на всех уровнях пищевых цепей. Тем не менее, типы метаболизма, основанные на использовании энергии света, весьма разнообразны. Если источником углерода при фотосинтезе служит углекислый газ, то есть происходит его фиксация с дальнейшим образованием органического вещества, то говорят о фиксации углекислого газа, а такие организмы называют фотоавтотрофами. Фотосинтез может также происходить без фиксации углерода с использованием готовых органических веществ вместо углекислого газа, такие организмы называют фотогетеротрофами. В качестве донора электронов для электронтранспортной цепи в фотосинтетических мембранах может использоваться вода. В этом случае одним из продуктов фотосинтеза является кислород и такой тип фотосинтеза называется оксигенным. В качестве донора электронов могут также выступать восстановленные органические или неорганические соединения. В таком случае продукты фотосинтеза не будут газообразными и такой тип фотосинтеза называется аноксигенным.
Фототрофные организмы чрезвычайно разнообразны: они отличаются строением клеток, типами фотосинтетических пигментов и многими другими особенностями. Фототрофные организмы часто формируют сложно устроенные сообщества, в которых занимают различные ниши. В этом задании вам предлагается изучить особенности фотосинтеза двух микроорганизмов: $A$ и $B$, и сделать заключения об их физиологии и экологии.
Часть E. Определение спектральной эффективности фотосинтеза в культурах двух микроорганизмов (6.4 балла)
В этом задании вам предстоит определить наличие и эффективность выделения кислорода культурами двух микроорганизмов А и В при освещении светом с различной длиной волны.
В качестве источника света выступают три батареи светодиодов: синего, зеленого и красного цветов. Каждая состоит из трех последовательно соединенных светодиодов.
На рисунке ниже представлены вольт-амперные характеристики светодиодов.
На рисунке ниже представлены зависимости мощности света $P$, излучаемого светодиодами от тока $I$, текущего через них.
Площадь внутреннего сечения шлангов составляет $S_0=1.77$ мм${}^2$. На установке по исследованию спектральной чувствительности фотосинтеза нужно измерить объем кислорода $V$, который выделяют микроорганизмы при освещении светом разного цвета.
Для этого вопроса используйте микроорганизм $A$.
Подготовьте установку к измерениям согласно инструкции G3.
Включите источник света и засеките время.
Заполните таблицу в листах ответов.
Чтобы сравнивать эффективности фотосинтеза $E$ различных микроорганизмов необходимо получить среднюю эффективность в пересчете на одну клетку и на мощность падающего излучения:
\[E = \frac{V_{\rm O_2}}{N \cdot P},\]где $V_{\rm O_2}$ – объем кислорода, который выделился за время освещения светом, $N$ — количество клеток освещаемых светом, $P$ — мощность излучения.
Ребро большого квадрата камеры Горяева — 0.2 мм, глубина камеры — 0.1 мм, большой квадрат состоит из 16 малых. Посчитайте общее количество клеток $N_A$ и $N_B$ микроорганизмов $A$ и $B$ внутри шприца объемом $20$ мл. Запишите расчетную формулу, как связаны $n_A$ и $N_A$.
Микроорганизм Красный Зелёный Синий $А$ $В$
Верно Неверно Нельзя заключить из эксперимента Организм $A$ не способен осуществлять фотосинтез при освещении зеленым светом Организм $B$ способен перемещаться в направлении более оптимальных условий фотосинтеза Организмы $A$ и $B$ осуществляют один и тот же тип фотосинтеза Организм $B$ эффективнее осуществляет фотосинтез при освещении красным светом Организм $B$ осуществляет аноксигенный фотосинтез
Пигментный состав в значительной степени определяет способность фотосинтезирующих организмов поглощать различные спектральные интервалы солнечного излучения. Пигментный состав может различаться у организмов разных систематических групп. К основным фотосинтетическим пигментами относятся хлорофиллы и каротиноиды. Они отличаются по химической структуре и физическим свойствам. Физические свойства наиболее важных пигментов, такие как максимумы поглощения и удельная подвижность, указаны в таблице ниже.
Пигменты Максимумы поглощения, нм $R_f$ Хлорофилл a 430, 660 0.48 Хлорофилл b 450, 660 0.38 Бактериохлорофилл 605, 780 0.42 Бактериофеофетин 550, 750 0.45
Характеристики спектров поглощения и удельной подвижности пигментов ($R_f$) хлорофиллов на хроматограмме
Пигмент Максимумы поглощения, нм $R_f$ Бета-каротин 430, 460, 490 0.98 Лютеин 420, 450, 480 0.35 Каротиноид 1 480, 500, 520 0.83 Каротиноид 2 480, 500, 520 0.62 Каротиноид 3 480, 500, 520 0.54
Характеристики спектров поглощения и удельной подвижности пигментов ($R_f$) каротиноидов на хроматограмме
Значение удельной подвижности расчитывают по формуле:
\[R_f=Z_x/Z_f,\] где $Z_x$ — расстояние между линией старта и центром пигментного пятна, а $Z_f$ — расстояние между линией страта и фронтом растворителя
В коробке к культурой микроорганизмов в маленьких пробирках находятся концентрированные экстракты этих микроорганизмов. Они понадобятся для проведения хроматографии и измерения их спектров поглощения. Объем экстрактов, которые вам выданы в пробирках, составляет около 150 мкл. Поэтому перед тем как их открыть, стряхните жидкость вниз.
Сразу после окончания хроматографии и высушивания пластины, проанализировав таблицу, аккуратно отметьте карандашом на пластинке знаком «Х» пятна, соответствующие хлорофиллам и знаком «О» пятна, соответствующие каротиноидам.
Поднимите табличку HELP, чтобы к вам подошел ассистент и сфотографировал пластину.
Поместите размеченную пластину в Answer tube F1.
Возьмите три пластиковые кюветы. В каждую из них налейте 3 мл спирта. Одну из кювет используйте для снятия Baseline, а в другие добавьте по 50 мкл экстрактов микроорганизмов $A$ и $B$. Хорошо перемешайте разбавленные экстракты.
Сохраните измеренные спектры в папку на рабочем столе “Results/F2” под именами “F2.A.txt” и “F2.B.txt” соответственно для микроорганизмов $A$ и $B$.
Отлейте 3 мл растворов экстрактов микроорганизмов, которые вы измеряли, в Answer tube F2.A и Answer tube F2.B.
Верно Неверно Хлорофиллы будут иметь два максимума в красной и синей области на спектре поглощения. Каротиноиды можно найти на хроматограмме организма $B$. Каротиноиды более полярны, чем хлорофиллы. Каротиноиды в данном эксперименте можно однозначно идентифицировать только по их подвижности, так как их спектры поглощения схожи. На хроматограмме экстракта организма А наибольшей подвижностью отличаются хлорофиллы. Бактериохлорофилл поглощает более длинноволновую часть спектра, чем хлорофиллы. Каротиноиды участвуют в переносе электрона по фотосинтетической электронтранспортной цепи.
Верно Неверно Организм В при фотосинтезе может использовать более длинноволновую часть спектра. Пигментные составы у организмов $A$ и $B$ совпадают. В смешанных сообществах организм В обнаруживается в более глубоких слоях, чем организм $A$. Наборы каротиноидов у обоих организмов совпадают.
В небольших водоемах сообщество микроорганизмов распределяется в соответствии с физиологическими особенностями. В воде небольших водоемов при плохом перемешивании воды образуется зона скачка концентрации кислорода, когда в глубоких слоях создаются анаэробные условия. Фототрофные организмы в отсутствии кислорода используют в качестве донора электрона не воду, как цианобактерии и зеленые водоросли, а другие соединения, при этом кислород не выделяется — такой фотосинтез называется аноксигенным.
В толще водоема фототрофные микроорганизмы распределяются в зависимости от отношения к кислороду (аэробные и анаэробные) и способности поглощать свет в различных частях спектра.
Известно, например, что среди аноксигенных фототрофных бактерий зеленые бактерии анаэробны и многие из них хорошо приспособлены к использованию света низкой интенсивности, а пурпурные бактерии устойчивы к кислороду.
Верно Неверно Зеленые водоросли являются аэробными микроорганизмами. Пурпурные и зеленые бактерии осуществляют оксигенный фотосинтез. Фототрофные бактерии могут использовать восстановленные соединения серы как донор электронов при аноксигенном фотосинтезе. Цианобактерии в основном живут в анаэробных условиях.
Запишите номера организмов в таблицу в листе ответов.
Зона водоёма Микроорганизмы A B C D
Микроорганизм Зона водоёма Микроорганизм $A$ Микроорганизм $B$
Верно Неверно Микроорганизмы могут перемещаться в толще мата. В верхнем слое цианобактериального мата при ярком освещении возрастает риск фотоповреждений фотосинтетического аппарата клеток. Нефототрофные микроорганизмы могут существовать только в глубине цианобактериального мата. Фототрофные микроорганизмы, обладающие различным набором пигментов, могут меняться местами в зависимости от изменения набора длин волн солнечного света. На восходе и на закате наиболее активно будут фотосинтезировать бактерии, способные поглощать свет в более коротковолновой области спектра.